Quelles sont les variantes du coronavirus qui inquiètent le monde aujourd'hui

La pandémie de coronavirus se poursuit. Rien qu'hier, il y a eu 573 000 nouvelles infections malgré le fait que de nombreux pays aient levé toutes les restrictions et que les gens ne suivent guère la question avec inquiétude.

Les 92 600 positifs en Allemagne ou les près de 30 000 infectés au Royaume-Uni enregistrés il y a tout juste un jour, plus les confinements massifs en Chine, ou la campagne générale au Japon, qui connaît une résurgence avec près de 50 000 infections au cours des dernières 24 heures, sont des exemples concrets qui Le SARS-CoV-2 continue de progresser. Même si dans de nombreuses régions, comme la nôtre, il semble que la pandémie ne soit pas perçue.

Selon les données épidémiologiques de tous les pays, la variante qui circule dans le monde aujourd'hui est Ómicron, qui a déplacé Delta à la fin de 2021. Mais les experts de la santé du monde entier sont à l'affût d'éventuelles nouvelles variantes ou sous-variantes plus contagieuses qui pourraient apparaître.

« L'émergence de nouvelles variantes du coronavirus résulte de sa capacité à se répliquer, ce qui le fait des milliards de fois et aide le virus à modifier ses caractéristiques génétiques et à trouver des moyens de survivre dans un environnement hostile », a déclaré l'infectiologue et membre de la Commission des vaccins de la Société argentine d'infectiologie (Sadi) Francisco Nacinovich (75 823).

Les virus tels que le SARS-CoV-2 évoluent constamment à mesure que des modifications du code génétique (mutations génétiques) se produisent au cours de la réplication du génome. Une lignée est un groupe de variants génétiquement proches de virus dérivés d'un ancêtre commun. Un variant, quant à lui, possède une ou plusieurs mutations qui le différencient des autres variants du SARS-CoV-2.

Comme prévu, plusieurs variants du virus COVID-19 ont été documentés aux États-Unis et dans le monde entier pendant cette pandémie. Pour éclairer les enquêtes locales sur les éclosions et comprendre les tendances nationales, les scientifiques comparent les différences génétiques des agents pathogènes afin d'identifier les variants et leur lien étroit les uns avec les autres.

L'Organisation mondiale de la santé (OMS), en collaboration avec les pays, les réseaux d'experts, les institutions et les chercheurs, suit et évalue l'évolution du SARS-CoV-2 depuis janvier 2020. L'émergence de variants qui présentaient un risque accru pour la santé publique mondiale, à la fin de 2020, a incité à utiliser les catégories spécifiques de « variant d'intérêt (VOI) » et de « variant préoccupant (COV) » pour donner la priorité à la surveillance et à la recherche mondiales et, en fin de compte, orienter la réponse à la pandémie.

« Des systèmes mondiaux ont été mis en place, dont l'efficacité est actuellement renforcée, pour détecter les « signes » d'éventuels variants préoccupants et pour les évaluer en fonction du risque qu'ils posent pour la santé publique mondiale. Cependant, les autorités nationales peuvent choisir de désigner d'autres variantes possibles préoccupantes et intéressantes au niveau local », indique l'OMS dans son dernier bulletin hebdomadaire.

Les stratégies et mesures actuellement recommandées par l'OMS continuent de lutter contre les variants du virus détectés depuis le début de la pandémie. Dans de nombreux pays où la transmission de variants inquiétants est généralisée, il a été démontré que les mesures sociales et de santé publique, telles que la prévention et le contrôle des infections, réduisent efficacement le nombre de cas, d'hospitalisations et de décès dus à la COVID-19.

Variantes préoccupantes et intéressantes

Une variante du SARS-CoV-2 qui répond aux critères pour être défini comme un « COV » répond à un ou plusieurs des changements respectifs suivants d'un Variant d'intérêt (VOI), dans une mesure significative pour la santé publique mondiale

-Transmissibilité accrue ou modification néfaste de l'épidémiologie de la COVID-19

-Augmentation de la virulence ou modification du tableau clinique de la maladie

-Diminution de l'efficacité des mesures sociales et de santé publique ou des outils de diagnostic, des vaccins et des traitements disponibles

Actuellement, l'OMS classe deux variants comme COV : Delta (B1.617.2) et Ómicron (B.1.1529). Et il classe Alpha (B.1.1.7 - britannique), bêta (B.1.351 - sud-africain) et gamma (P.1 - Manaus) comme des variantes inquiétantes précédemment en circulation. Les variants préoccupants ou intéressants dont il a été démontré qu'ils ne présentent plus de risque supplémentaire significatif pour la santé publique mondiale par rapport aux autres variants circulants du SARS-CoV-2 peuvent être classés comme des variants préoccupants ou des variants d'intérêt précédemment en circulation.

À cette fin, les experts, en collaboration avec le Groupe consultatif technique sur l'évolution des virus, procèdent à une évaluation rigoureuse de plusieurs critères, tels que l'incidence observée ou la prévalence relative de variants détectés dans des échantillons séquencés au fil du temps et dans différents les emplacements, la présence ou l'absence d'autres facteurs de risque et les implications actuelles possibles pour les mesures de contrôle.

« Les États membres devraient continuer à surveiller les variants, y compris les variants préoccupants ou les variants présentant un intérêt antérieurement en circulation, et signaler toute augmentation des cas observés associés à ces virus. Le passage d'une variante inquiétante en circulation et d'une variante d'intérêt en circulation à une variante préoccupante précédemment en circulation et à une variante d'intérêt précédemment en circulation, respectivement, traduit une forte baisse de leur circulation, mais la possibilité que la circulation de ces variants ne peut être exclu que le reclassement augmentera à l'avenir », insiste l'OMS dans la communication.

Nouveaux sous-variants sous surveillance

Toute variante du SARS-CoV-2 dont les modifications du génome sont soupçonnées d'affecter les caractéristiques du virus et qui semblent indiquer que le variant pourrait présenter des risques à l'avenir, bien qu'il n'y ait aucune preuve claire de changements qu'elle pourrait provoquer dans le phénotype ou sur les caractéristiques épidémiologiques du virus et il est nécessaire de maintenir une surveillance et des études supplémentaires jusqu'à ce que de plus amples informations soient disponibles.

C'est pourquoi l'OMS suit la croissance de plusieurs sous-variants pour voir s'ils deviennent d'autres variants du coronavirus. Toutes les versions d'Ómicron sont hautement contagieuses, de sorte que la variante a rapidement remplacé les formes précédentes du coronavirus, telles que Delta. En outre, plusieurs études ont révélé que BA.2 est encore plus transmissible que BA.1 ou appelé Ómicron original.

« La Health Safety Agency du Royaume-Uni estime que la sous-variante BA.2 croît 80 % plus rapidement que BA.1. Toujours aux États-Unis, le BA.2 semble être en voie de dépasser le BA.1 pour devenir la variante dominante », a expliqué le Dr Leana Wen, médecin des urgences et professeur de politique de santé à la Milken Institute School of Public Health du Milken University Milken Institute de l'Université George Washington. L'expert a convenu que « la bonne nouvelle est que la sous-variante BA.2 ne semble pas causer de maladie plus grave que BA.1 ».

Selon les Centers for Disease Control and Prevention (CDC), BA.2 est actuellement responsable d'un tiers des infections aux États-Unis, mais les cas de COVID-19 ont suivi la tendance à la baisse qui a marqué la fin de l'augmentation du BA.1 d'Ómicron. Le Dr John Brooks, épidémiologiste médical des CDC et directeur médical de la réponse à la COVID-19, a déclaré que si les infections liées à la BA.2 pourraient augmenter, les maladies graves ou les décès associés à la sous-variante sont peu susceptibles d'augmenter.

L'OMS suit actuellement deux nouvelles lignées du variant Ómicron (BA.4 et BA.5), dont « des mutations supplémentaires doivent être étudiées plus avant pour comprendre leur impact sur le potentiel d'évasion immunitaire ». L'agence des Nations Unies travaille avec des scientifiques pour mieux comprendre leur propagation actuelle, ainsi que les impacts potentiels qu'ils peuvent avoir. Jusqu'à présent, selon les données détenues par cette agence, seules quelques dizaines de séquences de ces variants ont été signalées dans une poignée de pays. Il s'agit des lignées XD ou Deltacron et XE.

Le 7 janvier, Leondios Kostrikis, professeur de sciences biologiques à l'Université de Chypre et chef du Laboratoire de biotechnologie et de virologie moléculaire, a annoncé que son groupe de recherche de l'Université de Chypre à Nicosie avait identifié plusieurs génomes du SARS-CoV-2 contenant des éléments du Delta et Omicron.

À partir de ce moment, ils ont décidé de le nommer « Deltacron » et Kostrikis, avec son équipe, a téléchargé 25 des séquences dans le dépôt public de GISAID et, quelques jours plus tard, en a ajouté 27 autres. En une seule journée, le journal Bloomberg a diffusé ce qui s'est passé et Deltacron est rapidement devenu l'actualité internationale.

En ce qui concerne la XE, à l'heure actuelle, les premiers rapports la décrivent comme silencieuse, hautement contagieuse et avec des symptômes encore peu clairs, le fait est que la XE serait transmise 10% plus rapidement que ses prédécesseurs et que sa vitesse de propagation est toujours à l'étude.

Dans les virus, comme dans tout organisme, des mutations aléatoires se produisent, c'est-à-dire des altérations du matériel génétique. La plupart de ces mutations n'auront aucun effet, mais d'autres peuvent modifier les caractéristiques du virus, elles peuvent même lui apporter des avantages.

La Dre Angela Rasmussen, virologue à l'Université de la Saskatchewan, au Canada, a déclaré qu' « il n'y a aucune raison d'être nerveux ». Il a noté que XE est l'un des nombreux recombinants d'Ómicron BA.1 et BA.2. « En tant que tel, même s'il réussira, ce sera toujours une sous-lignée d'Ómicron. » Delta possédait plus de 200 sous-lignages de ce type avant d'être déplacé par Ómicron. Il a également noté que « XE n'est pas une lettre grecque qui désigne une nouvelle variante d'intérêt. Ce n'est qu'une recombinaison d'Ómicron, le cinquième identifié, après XA, XB, XC et XD. » Il a indiqué que les mêmes précautions devraient être prises pour la COVID-19 en général.

Le Directeur général de l'OMS, le Dr Tedros Adhanom Gebreyesus, a déclaré qu' « il est encourageant de constater une tendance à la baisse des décès enregistrés (dus à la COVID-19), qui ont été les plus bas enregistrés la semaine dernière au cours des deux dernières années ». Cependant, le responsable de l'entité sanitaire internationale a répété que la pandémie « est loin d'être terminée ».

La transmission reste très élevée et la couverture vaccinale reste très faible dans trop de pays et l'assouplissement de nombreuses mesures sociales et de santé publique permet la poursuite de la transmission, avec le risque d'apparition de nouveaux variants, a expliqué Tedros. Il a ajouté que « la COVID-19 affecte désormais les pays de manière très différente ». Dans les pays où l'immunité de la population est élevée, il existe une dissociation entre les cas, les hospitalisations et les décès ; dans d'autres pays où l'accès aux vaccins est limité, l'augmentation massive des cas a entraîné un grand nombre d'hospitalisations et encore plus de décès par rapport aux vagues précédentes.

Alors que la pandémie vient d'entrer dans sa troisième année, le réalisateur s'inquiète de trois facteurs. Tout d'abord, la fatigue de la population. Deuxièmement, la durée de l'immunité résultant d'une vaccination ou d'une infection antérieure reste incertaine. Troisièmement, nous ne pouvons pas prédire comment le virus évoluera.

Malgré les incertitudes, il a rappelé que le monde dispose des outils pour limiter la transmission, sauver des vies et protéger les systèmes de santé : « Nous avons les systèmes pour mieux comprendre le virus à mesure qu'il évolue, et nous avons les vaccins, les tests, le traitement et les mesures sociales et de santé publique pour mettre fin à la phase aiguë de la Pandémie de COVID-19 », a conclu le responsable.

Le scénario le plus plausible est que le virus continue d'évoluer, mais que la gravité de la maladie qu'il provoque diminue avec le temps à mesure que l'immunité augmente en raison de la vaccination et de l'infection. La deuxième possibilité est le meilleur scénario : l'émergence de variants moins graves contre lesquels des rappels ou de nouvelles formulations de vaccins ne sont pas nécessaires. Cependant, le troisième scénario est le pire possible, l'émergence d'une variante plus virulente et hautement transmissible.

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